Struktur organisasi SINDIKASI diselenggarakan oleh anggota yang diangkat atau ditunjuk melalui resolusi kongres, konferensi wilayah (konferwil) atau keputusan organisasi lainnya. Struktur ini terdiri dari Majelis Pertimbangan Organisasi (MPO), Majelis Etik (ME), Dewan Pengurus Nasional (DPN), Komite Pekerja Nasional, Sekretariat Nasional, Dewan Pengurus Wilayah (DPW), Dewan Pengurus Biro, dan Dewan Badan Otonom.
Berikut adalah gambaran struktur organisasi SINDIKASI:
Dewan Pengurus Wilayah (DPW) SINDIKASI Jawa Timur
Setelah melewati proses pembentukan Komite Persiapan SINDIKASI Jawa Timur selama bulan Maret - Oktober 2024, Konferensi Wilayah I SINDIKASI Jawa Timur secara resmi menetapkan Veronica Ajeng Larasati sebagai Ketua Wilayah dan Rangga Ilyasa sebagai Sekretaris Wilayah untuk periode 2024—2027, dengan program besar dan resolusi yang dapat disimak di
Ketua Wilayah
Ajeng Larasati
Sekretaris Wilayah
Rangga Ilyasa
Bendahara Wilayah
Achmad Assifa Januar
Divisi Pembelaan Hukum
Anindya Shabrina
Rifqy Azriel
Divisi Gender & Keadilan Sosial
Gusti Ayu Made Kayika
Divisi Pendidikan & Penelitian
kathleen azali
Divisi Media, Komunikasi dan Propaganda
Redi Murti Rosyidi